Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TP20293 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TP20293 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP20293 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP20293 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP20293 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP20293 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP20293 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TP20293 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP20293 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP20293 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP20293 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP20293 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP20293 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP20293 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP20293 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP20293 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP20293 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP20293 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP20293 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP20293 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP20293 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP20293 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP20293 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP20293 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP20293 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP20293 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP20293 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP20293 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP20293 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP20293 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP20293 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP20293 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP20293 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP20293 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP20293 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP20293 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP20293 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP20293 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP20293 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP20293 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP20293 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TP20293 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP20293 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP20293 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TP20293 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP20293 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP20293 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP20293 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TP20293 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP20293 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP20293 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TP20293 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP20293 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP20293 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP20293 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP20293 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP20293 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP20293 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP20293 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP20293 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP20293 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP20293 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP20293 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP20293 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP20293 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP20293 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP20293 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP20293 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP20293 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP20293 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP20293 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP20293 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP20293 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP20293 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP20293 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP20293 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TP20293 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP20293 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP20293 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP20293 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP20293 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP20293 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TP20293 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP20293 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP20293 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP20293 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP20293 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TP20293 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP20293 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TP20293 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP20293 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TP20293 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP20293 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP20293 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP20293 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TP20293 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TP20293 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TP20293 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP20293 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms