Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Phka1P18826 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Phka1P18826 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Phka1P18826 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Phka1P18826 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Phka1P18826 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Phka1P18826 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Phka1P18826 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Phka1P18826 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phka1P18826 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phka1P18826 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phka1P18826 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phka1P18826 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Phka1P18826 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Phka1P18826 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Phka1P18826 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Phka1P18826 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Phka1P18826 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Phka1P18826 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Phka1P18826 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Phka1P18826 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Phka1P18826 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Phka1P18826 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phka1P18826 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phka1P18826 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phka1P18826 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Phka1P18826 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phka1P18826 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Phka1P18826 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Phka1P18826 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Phka1P18826 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Phka1P18826 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Phka1P18826 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phka1P18826 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phka1P18826 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Phka1P18826 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Phka1P18826 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phka1P18826 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phka1P18826 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Phka1P18826 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Phka1P18826 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Phka1P18826 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Phka1P18826 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Phka1P18826 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Phka1P18826 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Phka1P18826 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Phka1P18826 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phka1P18826 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phka1P18826 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Phka1P18826 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Phka1P18826 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phka1P18826 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Phka1P18826 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Phka1P18826 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Phka1P18826 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Phka1P18826 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phka1P18826 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phka1P18826 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Phka1P18826 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms