Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SptbP15508 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SptbP15508 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SptbP15508 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SptbP15508 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SptbP15508 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SptbP15508 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SptbP15508 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SptbP15508 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SptbP15508 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SptbP15508 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SptbP15508 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SptbP15508 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SptbP15508 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SptbP15508 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SptbP15508 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SptbP15508 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SptbP15508 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SptbP15508 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SptbP15508 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SptbP15508 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SptbP15508 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SptbP15508 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SptbP15508 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SptbP15508 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SptbP15508 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SptbP15508 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SptbP15508 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SptbP15508 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SptbP15508 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SptbP15508 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SptbP15508 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SptbP15508 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SptbP15508 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SptbP15508 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SptbP15508 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SptbP15508 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SptbP15508 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SptbP15508 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SptbP15508 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SptbP15508 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SptbP15508 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SptbP15508 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SptbP15508 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SptbP15508 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SptbP15508 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SptbP15508 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SptbP15508 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SptbP15508 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SptbP15508 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SptbP15508 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SptbP15508 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SptbP15508 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SptbP15508 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SptbP15508 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SptbP15508 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SptbP15508 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SptbP15508 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SptbP15508 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SptbP15508 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SptbP15508 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SptbP15508 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SptbP15508 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SptbP15508 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SptbP15508 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SptbP15508 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SptbP15508 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SptbP15508 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SptbP15508 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SptbP15508 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SptbP15508 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SptbP15508 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SptbP15508 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SptbP15508 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SptbP15508 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SptbP15508 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SptbP15508 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SptbP15508 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SptbP15508 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SptbP15508 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SptbP15508 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SptbP15508 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SptbP15508 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SptbP15508 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SptbP15508 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SptbP15508 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SptbP15508 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SptbP15508 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SptbP15508 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SptbP15508 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SptbP15508 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SptbP15508 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SptbP15508 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SptbP15508 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SptbP15508 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SptbP15508 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SptbP15508 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SptbP15508 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SptbP15508 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SptbP15508 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms