Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vpreb2P13373 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vpreb2P13373 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vpreb2P13373 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vpreb2P13373 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms