Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chrm1P12657 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrm1P12657 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrm1P12657 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chrm1P12657 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Chrm1P12657 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chrm1P12657 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chrm1P12657 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chrm1P12657 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chrm1P12657 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chrm1P12657 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chrm1P12657 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chrm1P12657 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrm1P12657 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chrm1P12657 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrm1P12657 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrm1P12657 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chrm1P12657 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Chrm1P12657 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chrm1P12657 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chrm1P12657 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chrm1P12657 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chrm1P12657 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chrm1P12657 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chrm1P12657 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms