Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcea1P10711 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcea1P10711 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcea1P10711 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcea1P10711 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tcea1P10711 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcea1P10711 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcea1P10711 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcea1P10711 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcea1P10711 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcea1P10711 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcea1P10711 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcea1P10711 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcea1P10711 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcea1P10711 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcea1P10711 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcea1P10711 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcea1P10711 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcea1P10711 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcea1P10711 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea1P10711 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms