Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P10404 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P10404 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P10404 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P10404 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P10404 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P10404 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P10404 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P10404 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P10404 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P10404 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P10404 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P10404 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P10404 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P10404 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P10404 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P10404 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P10404 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P10404 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P10404 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P10404 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P10404 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P10404 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P10404 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P10404 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P10404 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P10404 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P10404 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P10404 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P10404 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P10404 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P10404 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P10404 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P10404 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P10404 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P10404 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P10404 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P10404 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P10404 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P10404 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P10404 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P10404 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P10404 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P10404 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P10404 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P10404 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P10404 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
P10404 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
P10404 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
P10404 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P10404 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21■□□□□ 0.95
P10404 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
P10404 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P10404 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P10404 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P10404 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
P10404 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P10404 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P10404 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P10404 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
P10404 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P10404 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
P10404 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P10404 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P10404 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P10404 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P10404 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
P10404 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P10404 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P10404 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P10404 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P10404 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P10404 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P10404 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
P10404 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
P10404 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
P10404 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
P10404 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
P10404 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
P10404 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms