Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxb3P09026 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxb3P09026 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxb3P09026 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxb3P09026 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb3P09026 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb3P09026 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxb3P09026 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxb3P09026 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb3P09026 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb3P09026 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb3P09026 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb3P09026 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb3P09026 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb3P09026 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb3P09026 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb3P09026 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb3P09026 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxb3P09026 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxb3P09026 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb3P09026 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb3P09026 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms