Protein–RNA interactions for Protein: P06876

Myb, Transcriptional activator Myb, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MybP06876 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MybP06876 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MybP06876 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MybP06876 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MybP06876 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MybP06876 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MybP06876 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MybP06876 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MybP06876 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MybP06876 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MybP06876 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MybP06876 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MybP06876 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MybP06876 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MybP06876 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MybP06876 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MybP06876 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MybP06876 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MybP06876 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MybP06876 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MybP06876 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MybP06876 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MybP06876 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MybP06876 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MybP06876 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MybP06876 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MybP06876 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MybP06876 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MybP06876 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MybP06876 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MybP06876 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MybP06876 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MybP06876 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MybP06876 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MybP06876 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MybP06876 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MybP06876 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MybP06876 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MybP06876 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MybP06876 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MybP06876 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MybP06876 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MybP06876 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MybP06876 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MybP06876 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MybP06876 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MybP06876 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MybP06876 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MybP06876 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MybP06876 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MybP06876 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MybP06876 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MybP06876 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MybP06876 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MybP06876 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MybP06876 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MybP06876 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MybP06876 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MybP06876 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MybP06876 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MybP06876 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MybP06876 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MybP06876 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MybP06876 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MybP06876 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MybP06876 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MybP06876 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MybP06876 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MybP06876 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MybP06876 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MybP06876 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MybP06876 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MybP06876 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MybP06876 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MybP06876 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MybP06876 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MybP06876 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MybP06876 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MybP06876 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MybP06876 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MybP06876 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MybP06876 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MybP06876 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MybP06876 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MybP06876 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MybP06876 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MybP06876 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MybP06876 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MybP06876 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MybP06876 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MybP06876 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MybP06876 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MybP06876 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MybP06876 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MybP06876 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MybP06876 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MybP06876 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MybP06876 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MybP06876 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MybP06876 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms