Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06334 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06334 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06334 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P06334 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P06334 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P06334 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P06334 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P06334 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06334 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06334 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06334 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06334 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06334 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06334 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06334 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06334 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06334 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06334 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06334 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06334 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06334 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P06334 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P06334 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06334 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06334 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06334 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06334 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06334 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06334 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06334 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06334 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06334 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06334 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06334 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06334 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06334 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06334 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06334 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06334 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06334 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06334 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06334 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06334 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06334 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06334 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06334 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06334 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06334 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P06334 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P06334 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06334 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06334 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06334 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06334 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06334 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06334 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06334 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06334 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P06334 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P06334 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06334 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06334 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06334 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06334 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06334 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06334 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06334 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06334 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06334 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06334 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06334 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P06334 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P06334 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06334 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06334 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06334 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06334 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06334 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06334 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06334 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06334 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06334 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06334 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06334 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06334 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P06334 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06334 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06334 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06334 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06334 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06334 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06334 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06334 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06334 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06334 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06334 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06334 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06334 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06334 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms