Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops3O88543 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cops3O88543 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops3O88543 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops3O88543 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cops3O88543 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops3O88543 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops3O88543 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops3O88543 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops3O88543 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops3O88543 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops3O88543 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops3O88543 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops3O88543 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms