Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dll3O88516 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dll3O88516 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dll3O88516 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dll3O88516 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Dll3O88516 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dll3O88516 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dll3O88516 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dll3O88516 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dll3O88516 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dll3O88516 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dll3O88516 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dll3O88516 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dll3O88516 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dll3O88516 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dll3O88516 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms