Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dll3O88516 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dll3O88516 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dll3O88516 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dll3O88516 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Dll3O88516 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dll3O88516 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dll3O88516 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Dll3O88516 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dll3O88516 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dll3O88516 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dll3O88516 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dll3O88516 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dll3O88516 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dll3O88516 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dll3O88516 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dll3O88516 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dll3O88516 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dll3O88516 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dll3O88516 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dll3O88516 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dll3O88516 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dll3O88516 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dll3O88516 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dll3O88516 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dll3O88516 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms