Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col5a1O88207 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Col5a1O88207 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col5a1O88207 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col5a1O88207 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col5a1O88207 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a1O88207 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col5a1O88207 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col5a1O88207 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col5a1O88207 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col5a1O88207 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col5a1O88207 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col5a1O88207 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col5a1O88207 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col5a1O88207 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col5a1O88207 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col5a1O88207 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col5a1O88207 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col5a1O88207 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Col5a1O88207 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col5a1O88207 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col5a1O88207 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col5a1O88207 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col5a1O88207 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col5a1O88207 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col5a1O88207 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col5a1O88207 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col5a1O88207 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col5a1O88207 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col5a1O88207 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col5a1O88207 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col5a1O88207 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a1O88207 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col5a1O88207 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col5a1O88207 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col5a1O88207 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col5a1O88207 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col5a1O88207 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a1O88207 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col5a1O88207 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col5a1O88207 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col5a1O88207 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col5a1O88207 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col5a1O88207 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col5a1O88207 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col5a1O88207 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col5a1O88207 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col5a1O88207 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col5a1O88207 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col5a1O88207 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col5a1O88207 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col5a1O88207 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col5a1O88207 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col5a1O88207 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col5a1O88207 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col5a1O88207 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col5a1O88207 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col5a1O88207 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms