Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stra6O70491 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stra6O70491 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stra6O70491 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stra6O70491 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stra6O70491 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra6O70491 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra6O70491 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stra6O70491 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra6O70491 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra6O70491 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stra6O70491 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stra6O70491 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stra6O70491 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stra6O70491 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stra6O70491 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Stra6O70491 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stra6O70491 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stra6O70491 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stra6O70491 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stra6O70491 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra6O70491 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra6O70491 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Stra6O70491 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stra6O70491 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stra6O70491 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stra6O70491 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stra6O70491 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stra6O70491 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stra6O70491 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Stra6O70491 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stra6O70491 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stra6O70491 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra6O70491 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra6O70491 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Stra6O70491 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stra6O70491 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stra6O70491 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stra6O70491 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra6O70491 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra6O70491 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stra6O70491 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stra6O70491 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stra6O70491 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stra6O70491 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra6O70491 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra6O70491 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stra6O70491 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stra6O70491 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Stra6O70491 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Stra6O70491 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra6O70491 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra6O70491 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stra6O70491 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stra6O70491 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stra6O70491 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra6O70491 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stra6O70491 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Stra6O70491 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stra6O70491 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra6O70491 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra6O70491 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra6O70491 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra6O70491 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra6O70491 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stra6O70491 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stra6O70491 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stra6O70491 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stra6O70491 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stra6O70491 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra6O70491 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms