Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn1O35350 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn1O35350 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn1O35350 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn1O35350 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn1O35350 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn1O35350 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn1O35350 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn1O35350 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn1O35350 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn1O35350 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn1O35350 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn1O35350 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn1O35350 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn1O35350 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn1O35350 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn1O35350 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn1O35350 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn1O35350 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn1O35350 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn1O35350 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn1O35350 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn1O35350 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn1O35350 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn1O35350 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn1O35350 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn1O35350 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn1O35350 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn1O35350 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn1O35350 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn1O35350 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn1O35350 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn1O35350 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms