Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Eftud2O08810 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eftud2O08810 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Eftud2O08810 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Eftud2O08810 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Eftud2O08810 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eftud2O08810 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eftud2O08810 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eftud2O08810 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eftud2O08810 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eftud2O08810 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Eftud2O08810 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eftud2O08810 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Eftud2O08810 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eftud2O08810 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eftud2O08810 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eftud2O08810 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eftud2O08810 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eftud2O08810 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eftud2O08810 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms