Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CckarO08786 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CckarO08786 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CckarO08786 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CckarO08786 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CckarO08786 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CckarO08786 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CckarO08786 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CckarO08786 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CckarO08786 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CckarO08786 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CckarO08786 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CckarO08786 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CckarO08786 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CckarO08786 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CckarO08786 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CckarO08786 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CckarO08786 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CckarO08786 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CckarO08786 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CckarO08786 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CckarO08786 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CckarO08786 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CckarO08786 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CckarO08786 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CckarO08786 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CckarO08786 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CckarO08786 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CckarO08786 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CckarO08786 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CckarO08786 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CckarO08786 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CckarO08786 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CckarO08786 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CckarO08786 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CckarO08786 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CckarO08786 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CckarO08786 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CckarO08786 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CckarO08786 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CckarO08786 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CckarO08786 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CckarO08786 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CckarO08786 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CckarO08786 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CckarO08786 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CckarO08786 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CckarO08786 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CckarO08786 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CckarO08786 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CckarO08786 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CckarO08786 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CckarO08786 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CckarO08786 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CckarO08786 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CckarO08786 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CckarO08786 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CckarO08786 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CckarO08786 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CckarO08786 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CckarO08786 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CckarO08786 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CckarO08786 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CckarO08786 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CckarO08786 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CckarO08786 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CckarO08786 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CckarO08786 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CckarO08786 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CckarO08786 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CckarO08786 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CckarO08786 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CckarO08786 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CckarO08786 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CckarO08786 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CckarO08786 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CckarO08786 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CckarO08786 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CckarO08786 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CckarO08786 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CckarO08786 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CckarO08786 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CckarO08786 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CckarO08786 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CckarO08786 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CckarO08786 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CckarO08786 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CckarO08786 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CckarO08786 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CckarO08786 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CckarO08786 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CckarO08786 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CckarO08786 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CckarO08786 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CckarO08786 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CckarO08786 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CckarO08786 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CckarO08786 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CckarO08786 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CckarO08786 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms