Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efna3O08545 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efna3O08545 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna3O08545 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna3O08545 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efna3O08545 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efna3O08545 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efna3O08545 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efna3O08545 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efna3O08545 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efna3O08545 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efna3O08545 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efna3O08545 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efna3O08545 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efna3O08545 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna3O08545 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna3O08545 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna3O08545 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna3O08545 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna3O08545 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms