Protein–RNA interactions for Protein: L7N228

Gm21750, Predicted gene, 21750, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21750L7N228 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21750L7N228 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21750L7N228 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21750L7N228 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21750L7N228 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21750L7N228 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21750L7N228 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21750L7N228 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21750L7N228 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21750L7N228 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21750L7N228 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm21750L7N228 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21750L7N228 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm21750L7N228 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21750L7N228 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21750L7N228 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21750L7N228 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21750L7N228 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21750L7N228 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21750L7N228 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms