Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20877J3QPZ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20877J3QPZ4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20877J3QPZ4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20877J3QPZ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20877J3QPZ4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20877J3QPZ4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms