Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm21972J3QN38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21972J3QN38 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21972J3QN38 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21972J3QN38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21972J3QN38 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21972J3QN38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21972J3QN38 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21972J3QN38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21972J3QN38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21972J3QN38 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21972J3QN38 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21972J3QN38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm21972J3QN38 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm21972J3QN38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21972J3QN38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms