Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34c3J3QJW5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c3J3QJW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34c3J3QJW5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34c3J3QJW5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34c3J3QJW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34c3J3QJW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c3J3QJW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c3J3QJW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c3J3QJW5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34c3J3QJW5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c3J3QJW5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34c3J3QJW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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