Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip12G5E870 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip12G5E870 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trip12G5E870 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip12G5E870 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip12G5E870 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip12G5E870 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip12G5E870 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip12G5E870 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip12G5E870 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip12G5E870 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip12G5E870 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip12G5E870 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip12G5E870 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip12G5E870 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip12G5E870 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trip12G5E870 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip12G5E870 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip12G5E870 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip12G5E870 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip12G5E870 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip12G5E870 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip12G5E870 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip12G5E870 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip12G5E870 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip12G5E870 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip12G5E870 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms