Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Arfgef1G3X9K3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Arfgef1G3X9K3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Arfgef1G3X9K3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Arfgef1G3X9K3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Arfgef1G3X9K3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Arfgef1G3X9K3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Arfgef1G3X9K3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Arfgef1G3X9K3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Arfgef1G3X9K3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Arfgef1G3X9K3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Arfgef1G3X9K3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Arfgef1G3X9K3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Arfgef1G3X9K3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Arfgef1G3X9K3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Arfgef1G3X9K3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Arfgef1G3X9K3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Arfgef1G3X9K3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Arfgef1G3X9K3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Arfgef1G3X9K3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Arfgef1G3X9K3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Arfgef1G3X9K3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Arfgef1G3X9K3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Arfgef1G3X9K3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Arfgef1G3X9K3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Arfgef1G3X9K3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Arfgef1G3X9K3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Arfgef1G3X9K3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Arfgef1G3X9K3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Arfgef1G3X9K3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Arfgef1G3X9K3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Arfgef1G3X9K3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Arfgef1G3X9K3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Arfgef1G3X9K3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Arfgef1G3X9K3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Arfgef1G3X9K3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Arfgef1G3X9K3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Arfgef1G3X9K3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Arfgef1G3X9K3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arfgef1G3X9K3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Arfgef1G3X9K3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Arfgef1G3X9K3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arfgef1G3X9K3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arfgef1G3X9K3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arfgef1G3X9K3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arfgef1G3X9K3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Arfgef1G3X9K3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Arfgef1G3X9K3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arfgef1G3X9K3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arfgef1G3X9K3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Arfgef1G3X9K3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Arfgef1G3X9K3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arfgef1G3X9K3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arfgef1G3X9K3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arfgef1G3X9K3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Arfgef1G3X9K3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Arfgef1G3X9K3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Arfgef1G3X9K3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms