Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm8909G3UXE9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm8909G3UXE9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm8909G3UXE9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm8909G3UXE9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm8909G3UXE9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm8909G3UXE9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm8909G3UXE9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm8909G3UXE9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm8909G3UXE9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm8909G3UXE9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm8909G3UXE9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm8909G3UXE9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm8909G3UXE9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gm8909G3UXE9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm8909G3UXE9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm8909G3UXE9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm8909G3UXE9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm8909G3UXE9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gm8909G3UXE9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm8909G3UXE9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm8909G3UXE9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm8909G3UXE9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm8909G3UXE9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm8909G3UXE9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm8909G3UXE9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm8909G3UXE9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm8909G3UXE9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm8909G3UXE9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm8909G3UXE9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm8909G3UXE9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm8909G3UXE9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm8909G3UXE9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm8909G3UXE9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm8909G3UXE9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm8909G3UXE9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm8909G3UXE9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm8909G3UXE9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm8909G3UXE9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm8909G3UXE9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm8909G3UXE9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm8909G3UXE9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm8909G3UXE9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm8909G3UXE9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm8909G3UXE9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm8909G3UXE9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm8909G3UXE9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm8909G3UXE9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm8909G3UXE9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm8909G3UXE9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm8909G3UXE9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm8909G3UXE9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm8909G3UXE9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm8909G3UXE9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm8909G3UXE9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm8909G3UXE9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm8909G3UXE9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm8909G3UXE9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm8909G3UXE9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm8909G3UXE9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm8909G3UXE9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm8909G3UXE9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm8909G3UXE9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm8909G3UXE9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm8909G3UXE9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm8909G3UXE9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms