Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms