Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pira2F8VQ94 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pira2F8VQ94 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pira2F8VQ94 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pira2F8VQ94 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pira2F8VQ94 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pira2F8VQ94 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pira2F8VQ94 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pira2F8VQ94 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms