Protein–RNA interactions for Protein: F7CXE4

Gm7535, Predicted gene 7535, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7535F7CXE4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7535F7CXE4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7535F7CXE4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7535F7CXE4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7535F7CXE4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7535F7CXE4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm7535F7CXE4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7535F7CXE4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7535F7CXE4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7535F7CXE4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm7535F7CXE4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm7535F7CXE4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm7535F7CXE4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm7535F7CXE4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7535F7CXE4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7535F7CXE4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm7535F7CXE4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7535F7CXE4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm7535F7CXE4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm7535F7CXE4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm7535F7CXE4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms