Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod3E9QA62 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod3E9QA62 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod3E9QA62 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod3E9QA62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod3E9QA62 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod3E9QA62 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod3E9QA62 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod3E9QA62 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod3E9QA62 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod3E9QA62 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmod3E9QA62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmod3E9QA62 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod3E9QA62 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod3E9QA62 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod3E9QA62 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmod3E9QA62 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod3E9QA62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod3E9QA62 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod3E9QA62 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod3E9QA62 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod3E9QA62 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod3E9QA62 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmod3E9QA62 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod3E9QA62 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod3E9QA62 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmod3E9QA62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod3E9QA62 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod3E9QA62 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod3E9QA62 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod3E9QA62 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod3E9QA62 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod3E9QA62 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod3E9QA62 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms