Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trip11E9Q512 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trip11E9Q512 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trip11E9Q512 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trip11E9Q512 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trip11E9Q512 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trip11E9Q512 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trip11E9Q512 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trip11E9Q512 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trip11E9Q512 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trip11E9Q512 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trip11E9Q512 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trip11E9Q512 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trip11E9Q512 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trip11E9Q512 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trip11E9Q512 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trip11E9Q512 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trip11E9Q512 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trip11E9Q512 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trip11E9Q512 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trip11E9Q512 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trip11E9Q512 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trip11E9Q512 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trip11E9Q512 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trip11E9Q512 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trip11E9Q512 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Trip11E9Q512 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trip11E9Q512 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trip11E9Q512 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trip11E9Q512 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trip11E9Q512 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trip11E9Q512 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trip11E9Q512 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trip11E9Q512 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trip11E9Q512 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trip11E9Q512 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trip11E9Q512 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trip11E9Q512 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trip11E9Q512 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trip11E9Q512 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trip11E9Q512 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trip11E9Q512 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trip11E9Q512 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trip11E9Q512 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trip11E9Q512 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trip11E9Q512 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trip11E9Q512 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trip11E9Q512 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trip11E9Q512 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trip11E9Q512 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trip11E9Q512 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trip11E9Q512 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trip11E9Q512 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trip11E9Q512 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trip11E9Q512 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trip11E9Q512 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trip11E9Q512 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trip11E9Q512 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trip11E9Q512 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trip11E9Q512 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms