Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd1E9Q3H4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd1E9Q3H4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd1E9Q3H4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd1E9Q3H4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd1E9Q3H4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd1E9Q3H4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd1E9Q3H4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Susd1E9Q3H4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd1E9Q3H4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Susd1E9Q3H4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Susd1E9Q3H4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Susd1E9Q3H4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd1E9Q3H4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd1E9Q3H4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Susd1E9Q3H4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Susd1E9Q3H4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Susd1E9Q3H4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Susd1E9Q3H4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Susd1E9Q3H4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Susd1E9Q3H4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Susd1E9Q3H4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Susd1E9Q3H4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Susd1E9Q3H4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Susd1E9Q3H4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Susd1E9Q3H4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Susd1E9Q3H4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Susd1E9Q3H4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Susd1E9Q3H4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Susd1E9Q3H4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd1E9Q3H4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms