Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f2E9Q366 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f2E9Q366 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f2E9Q366 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f2E9Q366 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f2E9Q366 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f2E9Q366 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Speer4f2E9Q366 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f2E9Q366 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4f2E9Q366 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4f2E9Q366 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4f2E9Q366 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4f2E9Q366 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4f2E9Q366 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Speer4f2E9Q366 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Speer4f2E9Q366 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Speer4f2E9Q366 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f2E9Q366 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f2E9Q366 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Speer4f2E9Q366 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Speer4f2E9Q366 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer4f2E9Q366 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f2E9Q366 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f2E9Q366 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Speer4f2E9Q366 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4f2E9Q366 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4f2E9Q366 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms