Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r49D3Z6L3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r49D3Z6L3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r49D3Z6L3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r49D3Z6L3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r49D3Z6L3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r49D3Z6L3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r49D3Z6L3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r49D3Z6L3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r49D3Z6L3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r49D3Z6L3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r49D3Z6L3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r49D3Z6L3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r49D3Z6L3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r49D3Z6L3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r49D3Z6L3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r49D3Z6L3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r49D3Z6L3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r49D3Z6L3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r49D3Z6L3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r49D3Z6L3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r49D3Z6L3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r49D3Z6L3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r49D3Z6L3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r49D3Z6L3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r49D3Z6L3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r49D3Z6L3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r49D3Z6L3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r49D3Z6L3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r49D3Z6L3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r49D3Z6L3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r49D3Z6L3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r49D3Z6L3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r49D3Z6L3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r49D3Z6L3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms