Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30cD3YVI9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim30cD3YVI9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim30cD3YVI9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim30cD3YVI9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim30cD3YVI9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim30cD3YVI9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim30cD3YVI9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim30cD3YVI9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim30cD3YVI9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim30cD3YVI9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim30cD3YVI9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim30cD3YVI9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim30cD3YVI9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim30cD3YVI9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim30cD3YVI9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim30cD3YVI9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim30cD3YVI9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim30cD3YVI9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim30cD3YVI9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim30cD3YVI9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim30cD3YVI9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim30cD3YVI9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim30cD3YVI9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms