Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930444P10RikD3YUR1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930444P10RikD3YUR1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930444P10RikD3YUR1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930444P10RikD3YUR1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
4930444P10RikD3YUR1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms