Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms