Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usf3B2RUQ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usf3B2RUQ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Usf3B2RUQ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usf3B2RUQ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usf3B2RUQ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usf3B2RUQ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usf3B2RUQ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usf3B2RUQ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usf3B2RUQ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usf3B2RUQ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usf3B2RUQ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usf3B2RUQ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usf3B2RUQ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usf3B2RUQ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usf3B2RUQ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms