Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Scn7aB1AYL1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Scn7aB1AYL1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Scn7aB1AYL1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Scn7aB1AYL1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Scn7aB1AYL1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Scn7aB1AYL1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Scn7aB1AYL1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Scn7aB1AYL1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Scn7aB1AYL1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scn7aB1AYL1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scn7aB1AYL1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scn7aB1AYL1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scn7aB1AYL1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Scn7aB1AYL1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Scn7aB1AYL1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Scn7aB1AYL1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Scn7aB1AYL1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Scn7aB1AYL1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Scn7aB1AYL1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Scn7aB1AYL1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Scn7aB1AYL1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Scn7aB1AYL1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Scn7aB1AYL1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Scn7aB1AYL1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Scn7aB1AYL1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Scn7aB1AYL1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Scn7aB1AYL1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Scn7aB1AYL1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Scn7aB1AYL1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Scn7aB1AYL1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scn7aB1AYL1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Scn7aB1AYL1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Scn7aB1AYL1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Scn7aB1AYL1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Scn7aB1AYL1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Scn7aB1AYL1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Scn7aB1AYL1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Scn7aB1AYL1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Scn7aB1AYL1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Scn7aB1AYL1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Scn7aB1AYL1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Scn7aB1AYL1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Scn7aB1AYL1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Scn7aB1AYL1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Scn7aB1AYL1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Scn7aB1AYL1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Scn7aB1AYL1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Scn7aB1AYL1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Scn7aB1AYL1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Scn7aB1AYL1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Scn7aB1AYL1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Scn7aB1AYL1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Scn7aB1AYL1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Scn7aB1AYL1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Scn7aB1AYL1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Scn7aB1AYL1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Scn7aB1AYL1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Scn7aB1AYL1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Scn7aB1AYL1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Scn7aB1AYL1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Scn7aB1AYL1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Scn7aB1AYL1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Scn7aB1AYL1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Scn7aB1AYL1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Scn7aB1AYL1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Scn7aB1AYL1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Scn7aB1AYL1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Scn7aB1AYL1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Scn7aB1AYL1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Scn7aB1AYL1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Scn7aB1AYL1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Scn7aB1AYL1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Scn7aB1AYL1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Scn7aB1AYL1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Scn7aB1AYL1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Scn7aB1AYL1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Scn7aB1AYL1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Scn7aB1AYL1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms