Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PtpruB1AUH1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PtpruB1AUH1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PtpruB1AUH1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PtpruB1AUH1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtpruB1AUH1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtpruB1AUH1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PtpruB1AUH1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PtpruB1AUH1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PtpruB1AUH1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PtpruB1AUH1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PtpruB1AUH1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PtpruB1AUH1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PtpruB1AUH1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtpruB1AUH1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PtpruB1AUH1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PtpruB1AUH1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtpruB1AUH1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtpruB1AUH1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtpruB1AUH1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PtpruB1AUH1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtpruB1AUH1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtpruB1AUH1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PtpruB1AUH1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtpruB1AUH1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PtpruB1AUH1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtpruB1AUH1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtpruB1AUH1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtpruB1AUH1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PtpruB1AUH1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PtpruB1AUH1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PtpruB1AUH1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtpruB1AUH1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtpruB1AUH1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PtpruB1AUH1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PtpruB1AUH1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtpruB1AUH1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtpruB1AUH1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtpruB1AUH1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PtpruB1AUH1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtpruB1AUH1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtpruB1AUH1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtpruB1AUH1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtpruB1AUH1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PtpruB1AUH1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PtpruB1AUH1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtpruB1AUH1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtpruB1AUH1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PtpruB1AUH1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtpruB1AUH1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtpruB1AUH1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtpruB1AUH1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtpruB1AUH1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtpruB1AUH1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PtpruB1AUH1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PtpruB1AUH1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PtpruB1AUH1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtpruB1AUH1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PtpruB1AUH1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PtpruB1AUH1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtpruB1AUH1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms