Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3173A6NAS3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3173A6NAS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3173A6NAS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3173A6NAS3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3173A6NAS3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3173A6NAS3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm3173A6NAS3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3173A6NAS3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3173A6NAS3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3173A6NAS3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3173A6NAS3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3173A6NAS3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3173A6NAS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3173A6NAS3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3173A6NAS3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3173A6NAS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3173A6NAS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3173A6NAS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3173A6NAS3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3173A6NAS3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3173A6NAS3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3173A6NAS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3173A6NAS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3173A6NAS3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3173A6NAS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3173A6NAS3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3173A6NAS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms