Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms