Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms