Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNF2

Lcmt1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcmt1A0A0U1RNF2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lcmt1A0A0U1RNF2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lcmt1A0A0U1RNF2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lcmt1A0A0U1RNF2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lcmt1A0A0U1RNF2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lcmt1A0A0U1RNF2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lcmt1A0A0U1RNF2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lcmt1A0A0U1RNF2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lcmt1A0A0U1RNF2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lcmt1A0A0U1RNF2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lcmt1A0A0U1RNF2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lcmt1A0A0U1RNF2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lcmt1A0A0U1RNF2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lcmt1A0A0U1RNF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lcmt1A0A0U1RNF2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lcmt1A0A0U1RNF2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lcmt1A0A0U1RNF2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lcmt1A0A0U1RNF2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lcmt1A0A0U1RNF2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lcmt1A0A0U1RNF2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lcmt1A0A0U1RNF2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lcmt1A0A0U1RNF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lcmt1A0A0U1RNF2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lcmt1A0A0U1RNF2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lcmt1A0A0U1RNF2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Lcmt1A0A0U1RNF2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lcmt1A0A0U1RNF2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lcmt1A0A0U1RNF2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lcmt1A0A0U1RNF2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lcmt1A0A0U1RNF2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lcmt1A0A0U1RNF2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lcmt1A0A0U1RNF2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Lcmt1A0A0U1RNF2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Lcmt1A0A0U1RNF2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lcmt1A0A0U1RNF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lcmt1A0A0U1RNF2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lcmt1A0A0U1RNF2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lcmt1A0A0U1RNF2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms