Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Trbv26A0A0B4J1P5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv26A0A0B4J1P5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trbv26A0A0B4J1P5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trbv26A0A0B4J1P5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trbv26A0A0B4J1P5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trbv26A0A0B4J1P5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv26A0A0B4J1P5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv26A0A0B4J1P5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv26A0A0B4J1P5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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