Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms