Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcea2Q9QVN7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms