Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms