Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bco1Q9JJS6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Bco1Q9JJS6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bco1Q9JJS6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms