Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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