Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap29Q9ERB0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms