Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms